elFinder

На нашем демо можете воспроизвести? Вероятней всего проблема с кодировкой. Файндер работает с utf-8

У вас работает, но Фаерфокс не завершает процесс: всё время возле курсора крутится индикатор, а в строке статуса: "Передача данных с lrte.org..." не меняется на "Готово".
В IE этой проблемы у вас нету.
Кодировку везде использую UTF-8
Тестирую на Денвере.
Хотя, если правильно понимаю, кодировка страницы с формой, где ckeditor с встроенным elFinder не должна влиять.

Я не совсем понял про глюк у нас на демо? Он появляется в FF 3.0.4 правильно? - то есть не происходит обновления после закачки файлов?

Обновление происходит.
Но FF продолждает ждать еще какого-то ответа от сервера.

Но это только в 3.0.x ? в более новых 3.5, 3.6 такого нет?

Просто на момент разработки elFinder'а FF 3.0.x уже морально подстаревший.

Новые версии я не ставил. Несколько версий не знаю как поставить.
Специально держу старую версию, чтобы тестировать свои сайты. Ведь далеко не все посетители следят за обновлениями.

Так какие мысли насчет полного неприятия кириллицы у меня?

А на каком сервере это крутиться? Поставьте FireBug и посмотрите какой ответ возвращает сервер после того как перестаёт отображаться содержимое.

Решение скинул в теме Транслитерация имен файлов и папок